Au sein de l'université, 3 conseils centraux sont des espaces privilégiés de débats autour des choix politiques et des principales décisions de gestion.
Ils réunissent des enseignants, des étudiants, des personnels administratifs (BIATOSS) et des personnalités extérieures.
C'est dans ces espaces que se manifestent la tradition démocratique de l'université qui allie débats serrés et nombreux et décision collective.
C'est aussi dans ces conseils que l'équipe de direction de l'université peut présenter sa politique.