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Formation LMD

Master Sciences du Vivant parcours Bioinformatique et Ingénierie Multi-omique en Santé et Environnement (BiOmics)

Nature :
Formation diplômante
Diplôme national
Type de diplôme :
Master
Durée des études :
2 ans
Année post-bac de sortie :
Bac + 5
Niveau de sortie :
Niveau 1
Lieu(x) de formation :
Créteil - Campus Centre
Accessible en :
  • Formation initiale
  • Formation continue

Domaine : Sciences - Technologie - Santé
Mention : Sciences du Vivant
UFR/Institut : UPEC - UFR de Sciences et technologie

Capacité d'accueil

20 étudiants

Objectifs

L'objectif général du master Sciences du vivant est de former des biologistes capables d’analyser, comprendre et agir sur les grands enjeux du vivant -de la santé humaine à la biodiversité des écosystèmes- dans un contexte de transitions biotechnologique, écologique et sociétale. Son parcours BiOmics forme des ingénieurs d'études spécialisés dans les interactions "Eco-Health" entre santé et environnement, capables de produire expérimentalement des données biologiques issues des technologies "omiques", combiner leurs utilisations, et traiter par analyse statistique et bioinformatique les données massives acquises. Ces approches multi-omiques et transdisciplinaires aident à identifier de nouveaux biomarqueurs et développer des nouvelles stratégies diagnostiques et thérapeutiques.

Compétence(s) visée(s)

- Piloter
- Analyser
- Résoudre
- Communiquer
- Concevoir
- Evaluer
 
Les étudiants sont formés au pilotage de projets de recherche en laboratoires ou plateformes technologiques : de l'identification des enjeux à la production expérimentale de données jusqu'au "reporting" des solutions proposées. Ils ont une double compétence paillasse (dissection, extraction, quantification de macromolécules...) et traitement in-silico des données en vue d'étudier des systèmes biologiques complexes de l’individu à l’écosystème. Ils assimilent des connaissances fondamentales en biologie de la santé et de l'environnement, qu’ils remobilisent dans l’application des technologies multi-omiques, avec des approches statistiques multivariées et de bioinformatique (languages R et Python).

Poursuites d'études

Doctorat en sciences du vivant et/ou de l'environnement

Débouchés professionnels

- Ingénieur d'etudes/responsable de projet d’analyses omiques en santé et/ou environnement.
- Gestionnaire/ "manager" de bases de données
- Secteur Recherche et Développement des laboratoires académiques et industriels privés, des plateformes de services d'analyses en technologiques omiques, dans les domaines hospitalier, de la recherche et du diagnostic en bio-santé et en environnement

Labellisation du parcours Biomics depuis sa création en 2016, par le pôle de compétitivité Medicen, pour l'optimisation de l'attractivité de la formation, son adéquation avec les besoins des entreprises et l'employabilité des diplômés (voir partenariats).

Environnement de recherche

Quatre laboratoires de l'UPEC aux thématiques en santé et environnement, Gly-CRRET, LEESU, IEES Paris et IMRB, dont sont issus 30 enseignants-chercheurs de l'équipe pédagogique (64% du volume d'enseignement) et auxquels sont associés 25 intervenants extérieurs (académiques ou industriels pour 36% du volume d'heures)
Expertises de plus de 10 plateformes technologiques d'Ile de France : IGenSeq (ICM), ICAN lipidomics (IHU), IMRB (génomique et boinformatique UPEC), GLYCO-mix (Gly-CRRET UPEC), @bridge INRAE (génomique, transcriptomique), OSU-EFLUVE : PRAMMICS, Pasteur.
Plus de 50 laboratoires et entreprises associés au master comme terrains de stages de 1re et 2de années diversifiés en thématique et sur le territoire national et international (Espagne, Mexique, Tunisie, Irlande, Brésil, Japon...)

Statistiques

Le marché du travail autour des analyses biostatistiques et bioinformatiques des données omiques est en pleine essor dans tous les domaines d’applications de ces biotechnologies : la santé, l'environnement, la nutrition et la sécurité alimentaire. Adossée à plus d’une centaine de partenaires socio-économiques, de laboratoires de recherche publique ou d'entreprises privées, notre formation permet l’employabilité immédiate, dans l'année qui suit la diplômation, de près de 90% des diplômés : 56% d'entre eux occupent des postes d'ingénieur-e-s de plateformes, tandis que 32% poursuivent leurs études en doctorat.
Taux de réussite 90%
Taux de satisfaction : 95%

Organisation de la formation

Format de la formation
La formation se déroule majoritairement en présentiel avec accès aux outils numériques : office 360, équipe Teams, sharepoint, espace Cloud, adresse étudiante, emploi du temps en ligne, cours en ligne. Les équipes pédagogiques mettent en œuvre des méthodes multimodales : cours magistraux, travaux dirigés et travaux pratiques.

Méthodes pédagogiques mobilisées
Les équipes pédagogiques mettent en oeuvre des méthodes multimodales et adaptées à leurs publics : cours magistraux, projets collectifs et/ou travaux individuels 


Programme des enseignements

(Sous réserve de vote des instances)
 

Master 1

Semestre 1 - Blocs de compétences Niveau 1 : BC N1
UE BC1 PILOTER / N1 : Identifier les enjeux d'un projet
- ECUE 1 : Mondes Professionnels de la Santé et de l'Environnement (27h - 3 ECTS)
UE BC2 ANALYSER / N1 : Identifier les différents outils d'analyse
- ECUE 1 : BioStatistiques (27h - 3 ECTS)
- ECUE 2 : BioInformatique (27h - 3 ECTS)
UE BC3 RESOUDRE / N1 : Identifier les éléments d'un problème technologique
- ECUE 1 : Introduction aux Technologies OMICS (27h - 3 ECTS)
- ECUE 2 : Boîte a Outils en Chimie et Biologie Moléculaire (40h - 6 ECTS)
UE BC4 COMMUNIQUER / N1 : Comprendre un écrit scientifique en anglais.
- ECUE 1 : Anglais Scientifique S1 (27h - 3 ECTS)
UE BC6 CONCEVOIR / N1 : Identifier les éléments d'une problématique en biologie intégrative
- ECUE 1 : Génétique et Génomique des Populations (27h - 3 ECTS)
- ECUE 2 : Biologie intégrative de la cellule eucaryote (27h - 3 ECTS)
UE BC5 EVALUER / N1 : Identifier les éléments d’une problématique environnementale
- ECUE 1 : Ecologie Générale et Microbienne (27h - 3 ECTS)
Semestre 2– Blocs de compétences Niveau 2 : BC N2
UE BC1 PILOTER / N2 : Participer à un projet sous supervision SAE
- ECUE 1 : Management de plateformes omiques (54h - 6 ECTS)
UE BC2 ANALYSER / N2 : Appliquer des outils d'analyse sous supervision
- ECUE 1 : Data mining (27h - 3 ECTS)
UE BC3 RESOUDRE / N2 : Résoudre un problème en étant guidé
- ECUE 1 : Stage en milieu professionnel (2 mois - 6 ECTS)
UE BC4 COMMUNIQUER / N2 : Communiquer à l'oral en anglais avec un vocabulaire scientifique
- ECUE 1 : Anglais Scientifique S2 (27h - 3 ECTS)
UE BC6 CONCEVOIR / N2 : Combiner des approches pour formuler une stratégie multi-omique
- ECUE 1 : Concepts en Physiopathologie (27h - 3 ECTS)
- ECUE 2 : Génomique, Epigénomique et Transcriptomique (27h - 3 ECTS)
- ECUE 3 : Protéomique et Peptidomique (27h - 3 ECTS)
- ECUE 4 : Glycomique et Lipidomique (27h - 3 ECTS)


Master 2

Semestre 3 – Blocs de compétences Niveau 3 : BC N3
UE BC1 PILOTER / N3 : Gérer un projet en collectif SAE
- ECUE 1 : Projet de recherche multi-omiques (65h - 12 ECTS)
UE BC2 ANALYSER / N3 : Analyser des données complexes en autonomie
- ECUE 1 : Biostatistiques avancées et modélisation (27h - 3 ECTS)
- ECUE 2 : Machine learning et language Python (27h - 3 ECTS)
UE BC3 RESOUDRE / N2 : Résoudre un problème complexe en autonomie
- ECUE 1 : Boîte à outils avancés (27h - 3 ECTS)
UE BC4 COMMUNIQUER / N2 : Produire des écrits adaptés à différents contextes (anglais ou français)
- ECUE 1 : One Health Scientific Congress (27h - 3 ECTS)
UE BC6 CONCEVOIR / N2 : Intégrer les dimensions One Health pour une stratégie interdisciplinaire
- ECUE 1 : One-Health, Omiques en environnement (27h - 3 ECTS)
- ECUE 2 : One-Health, Omiques en santé (27h - 3 ECTS)
Semestre 4 – Blocs de compétences Niveau 4 : BC N4
UE BC ALL / N4 : Gérer un projet en Autonomie
- ECUE 1 : Stage en milieu professionnel (6 mois - 30 ECTS)

Stage / Alternance

La formation requiert la validation de deux stages en laboratoire ou en entreprise :
M1 semestre 2 : UE stage en milieu professionnel - 6 ECTS, 2 mois obligatoires d'avril à juin
M2 semestre 4 : UE stage de fin d'études - 30 ECTS, 5 à 6 mois obligatoires à partir de février

Présentation du stage pour évaluation sous forme d'un mémoire écrit et d'une soutenance orale devant un jury. La soutenance de stage de 2e année est effectuée en anglais. Chaque stagiaire est rattaché à et accompagné par un tuteur pédagogique, membre de l'équipe enseignante en plus de son encadrant professionnel.

Modalités de contrôle des connaissances

Les modalités de contrôle des connaissances sont arrêtées par la CFVU de l'Université. Elles sont disponibles auprès du service de scolarité de la composante, et affichées sur chaque fiche de formation (voir partie intitulée "Réglementation").Dans le cadre du parcours BiOmics, sous réserve de validation par vote de la CFVU, 10 UE sont évaluées en contrôle continu intégral (CCI), 10 UE sont évaluées en contrôle continu (CC) et examen terminal, 3 UE sont évaluées par un seul examen terminal.
 
Les 2 stages sont validés par un rapport écrit et un oral devant un jury.cf supra.

Calendrier pédagogique

Le calendrier pédagogique précisant les périodes de cours et d'examens de 1res et 2es sessions, de pause pédagogique et de périodes de révision, est voté chaque année et disponible sur ce site. Il est systématiquement présenté en détails à chaque rentrée d'année par l'équipe pédagogique.
Le volume horaire total de la formation est de 695 heures (470 heures en M1 et 225 heures en M2), ne comprenant pas les périodes de stages et de travail personnel.
La période de formation, de la rentrée aux dernières sessions de rattrapage des examens s'étend classiquement de la 1re semaine de septembre à la 1re quinzaine de juillet de chaque année universitaire.

Niveau(x) de recrutement

Bac + 3, Bac + 4, [ Autre ]

Modalités d'admission en formation initiale

Sur dossier et entretien
En master 1 : être titulaire a minima d'un DNL Sciences de la Vie, +/- de la Terre, de l'Environnement, Sciences pour la Santé, Chimie/SV,  Informatique/SV, Sciences Biomédicales
Faire la preuve de connaissances solides en biologie, biochimie, chimie générale et biostatistiques, et des outils technologiques associés.
Savoir mettre en place une démarche expérimentale pour répondre à une question scientifique simple, interpréter et critiquer des données scientifiques
En master 2 : mêmes attendus minimaux mais niveau master 1 ou 3e année ingénieur en biologie ou bioinformatique.
Sélection sur dossier par un jury d'admission adhoc.
Maîtrise d'un niveau 600/700 (TOEIC TOEFL) en anglais et 450 (TEF) en français pour étudiants étrangers

Modalités d'admission en formation continue

Public concerné
Salarié du secteur privé ou du secteur public souhaitant accéder à un niveau supérieur ou se réorienter, demandeur d'emploi
Pré-requis
Avoir niveau Bac+3 ou un diplôme équivalent ou obtenir le droit d'entrer en formation par le biais de la procédure de la validation des acquis professionnels et personnels (VAPP).
Etre en poste sous le régime de la formation continue. L'expérience professionnelle est prise en compte pour l'évaluation des pré-requis.
Tarif de la formation
9500 € par année de formation dans le cadre de la formation continue
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Possibilité de mettre en place un parcours spécifique 

VAE

Quels que soient votre âge, votre nationalité, votre statut, vous pouvez prétendre à la VAE si vous justifiez d'une expérience professionnelle et/ou personnelle d'au moins un an en lien direct avec ce diplôme.
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Candidature

Formation initiale
• Pour les candidatures en Master 1
- Etudiants ou adultes en reprise d’études : https://www.monmaster.gouv.fr/     
- Etudiants internationaux (hors Campus France) : https://www.monmaster.gouv.fr/ 
- Etudiants internationaux (procédure Campus France) : www.campusfrance.org
• Pour les candidatures en Master 2
- Etudiants ou adultes en reprise d’études : https://candidatures.u-pec.fr
- Etudiants internationaux (hors Campus France) : https://candidatures.u-pec.fr
- Etudiants internationaux (procédure Campus France) : www.campusfrance.org

Se référer aux informations disponibles sur chacun des sites en terme de calendrier et d'éléments du dossier qui permettront d'appréhender la cohérence du projet universitaire et professionnel du candidat. La présentation des expériences professionnelles de stage antérieures est vivement recommandée.

Partenariats

Le parcours BiOmics est labellisé par le pôle de compétitivité Medicen, rassemblant plus de 400 acteurs de l’écosystème de l’innovation santé en France, (centres de recherche académiques, start-ups, PMEs, ETIs, grandes entreprises, acteurs cliniques, écoles et universités, collectivités locales, acteurs du développement économique…en sciences de la vie, chimie, santé numérique).
Il s'adosse à plus de 10 plateformes technologiques (cf supra) et plus de 50 laboratoires d'accueil publics et privés en France et à l'international.
Le parcours BiOmics est associé à un projet de co-diplômation avec l'Université National autonomie du Mexique (UNAM) et un projet de Master européen Erasmus+ dans le domaine Drug Discovery.

Responsable(s)

Responsable de la mention : Françoise Lucas
Responsable du M1 et du M2 parcours BIOmics : Patricia Albanese

Secrétariat

Formation initiale
Master 1
Fryni Grekis
UPEC - UFR de sciences et technologie
Campus Centre de Créteil
Bâtiment P1 - 2e étage - Bureau P1 208
61, avenue du Général de Gaulle - 94010 Créteil cedex
Tél : 01 45 17 14 65 - grekis@u-pec.fr

Master 2
Laëtitia Ouaki
UPEC - UFR de sciences et technologie
Campus Centre de Créteil
Bâtiment P1 - 2e étage - Bureau P1 206
61, avenue du Général de Gaulle - 94010 Créteil cedex
laetitia.ouaki@u-pec.fr

Plus d'informations

Etudes et handicap
Aménagement des études et des examens, accès aux locaux et aux équipements scientifiques, l'UPEC propose aux usagers en situation d'handicap un accompagnement spécifique pour leur permettre d'étudier dans les meilleures conditions
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Mis à jour le 8 février 2026