L'UPEC a été parmi les premières universités à s'investir dans l'apprentissage avec la création du CFA Sup 2000 en 1990.
18 ans plus tard, ce centre de formation des apprentis est devenu interuniversitaire et a formé plus de 15000 apprentis.

Aujourd'hui sur les 31000 étudiants de l'UPEC, 1400 utilisent la voie de l'apprentissage à travers 42 formations avec six CFA partenaires différents.

Très prisée par les entreprises, cette modalité de formation est aussi encouragée par le Ministère de l'enseignement supérieur et de la recherche : le taux d'échec est très faible, avec 95% de diplômés.

C'est un mode d'acquisition d'une double compétence par l'université et par l'entreprise. L'insertion professionnelle est de meilleure qualité. La rémunération proposée aux apprentis permet à des jeunes qui n'auraient pas pu poursuivre leurs études pour des raisons financières de rester à l'université.